Autori opäť sľubujú obrovskú rozmanitosť prostredí, do ktorých počas hrania zavítate a po skúsenostiach s predošlými dielmi im nemám prečo neveriť. Podobný prísľub je vedený aj na stránku nelinearity misií, takže oproti minulým dielom opäť vzrastú možnosti, ako tú či onú situáciu vyriešiť. Hráčom, ktorí mali možnosť vzhliadnuť nejaké to video z Chaos Theory, dozaista neunikla nová vecička, ktorú dostal proti teroristom Sam Fisher do výbavy. Je ním nôž Henckelbach a počas hrania nájde naozaj široké uplatnenie. Pri chytení nepriateľa tak môže Sam použiť nôž ako donucovací prostriedok (priložením čepele na krk) a v prípade, že protivník je záťaž, stačí jeden elegantný vpich do krčnej žily a o jedného nepriateľa je menej (už len schovať bezvládne telo a ide sa ďalej). Ak však vaša obeť zistí vašu polohu predtým, než ju stihnete chytiť, nie je nič jednoduchšie, ako vykonať pár rezov resp. vpichov na torze protivníka a problém je zázračne vyriešený.

Nôž však môžete použiť aj na nenásilné účely, ako napríklad prerezávanie stien chatrných japonských barákov, kde priečky sú často tvorené len hrubším papierom či plátnom. Autori samozrejme nezostali len u tejto hračky a vašu výbavu opäť o čosi vylepšili. Týka sa to napríklad obľúbenej útočnej pušky SC-20K, s ktorou ste mohli, v prípade prepnutia na vrhač dômyselných zariadení, protivníkov efektne paralyzovať či omráčiť. S novým dielom prichádza aj novinka, ktorou je možnosť zameniť tento vrhač za nádstavec s brokovnicou, takže vám už blízke stretnutia s nepriateľom nebudú robiť problémy. S brokovnicou však prichádza aj nový ukazovateľ hluku, takže spomínaná zbraň sa dostane k slovu len vo výnimočných prípadoch, keď vám na vyvolaní alarmu v dôsledku rámusu nebude až tak záležať.

Ruka v ruke spolu s novinkami vo výbave prichádzajú aj Samove nové schopnosti a pohyby. V predchádzajúcom dieli pribudla Samovi schopnosť visieť za nohy a pohodovo strieľať na okoloidúce obete. V Chaos Theory mu okrem toho pribudne možnosť pod ním prechádzajúcich nepriateľov chytiť a uškrtiť. Z rôznych videí ste si tiež mohli všimnúť všakovaké špecialitky, akými sú napríklad chytenie osoby cez papierovú stenu či vyhodenie nič netušiaceho indivíduá z balkóna. Ďalšími novými pohybmi sú plazenie, ktoré si určite nájde v stealth akcii svoje uplatnenie či možnosť prehodiť si zbraň do druhej ruky, hlavne ak často využívate opatrené nakukovanie spoza rohu. Kompletného upgradu sa dočkal aj boj „hand to hand“, kde s novým dielom už nie je Sam taký bezbranný (doteraz ovládal len jeden neúčinný a žalostne pomalý ramenný výpad) a dokáže si hravo poradiť aj s pästnými súbojmi. Novými vylepšeniami bolo obdarené aj otváranie dverí, takže okrem štandardného otvorenia ako v minulých dieloch, pribudlo aj tiché, kde kontrolujete rýchlosť otvárania a veľkosť priechodu a hlučné, ktoré síce spôsobí nadmerné množstvo hluku, ale pravdepodobne poslúži na vyrážanie niektorých nevýpačiteľných dverí.

Viaceré zmeny však postihli schopnosti hlavnej postavy. Okrem pridania novej účinnej kamufláže, pomocou ktorej hravo zmiznete nepriateľom z očí (samozrejme, že táto vymoženosť bude značne obmedzená a ani náhodou neočakávajte pobehovanie po misii ako Predator), došlo k vypusteniu relatívne nepoužívanej schopnosti prilepenia sa k stene a streľby za roh. Autori dokonca uvažovali (a uvažujú) o odstránení užitočného pískania resp. hvízdania, ktorou ste úspešne lákali resp. odlákavali nepriateľov, ale dúfajme, že si tým Ubisoftu vstúpi do svedomia a túto hráčmi obľúbenú vymoženosť ponechá tak ako je. Bolo by, ale nanajvýš nefér, keby sa vylepšenia dočkal len kladný hrdina. Autori sľubujú u nepriateľoch vylepšenú umelú inteligenciu, ktorá má zaručiť to, že pri vašom odhalení nebudú len tupo stáť a strieľať vašim smerom, ale budú hľadať úkryt a snažiť sa vás obísť. Okrem toho sa ich výbava rozrástla o svetlice a svetelné tyčky, takže už zďaleka nebudú predstavovať také ľahké ciele ako doteraz.